環境調査会社「海游」（石垣市）の吉田稔代表によると、約２週間前に同海域で白化を確認。海域によっては水深５メートル前後の浅い場所で数キロにわたって白化は進み、水深がより深い所でも白化が見られる。
環境の変化に弱いミドリイシ類やトゲサンゴは比較的白化が進み、変化に強いとされるハマサンゴも白化し始めている。石西礁湖の全域で確認されているが、そのうち約２割は進行の度合いが高いという。
沖縄気象台によると、沖縄地方は６月１６日の梅雨明け後、太平洋高気圧に覆われて晴れる日が多く、海水温が高い。台風１号が接近した際、一時的に平年値の２９度まで下がったが、台風通過後は再び水温が上がり始め、３０度を超える日が続いている。
県内では１９９８年８月、台風の接近が少なかった影響で海温が高くなり、県全域で大規模な白化現象が見られた。吉田代表は台風の少なさや水温の高さが９８年に似ているとし「この状態が続くと深刻な状態になる。県内のサンゴの半分以上死滅する可能性がある」と指摘した。
